研究报告

南药胆木的基因组调查及SSR分子标记分析  

张璟璇1 , 涂梦薇2 , 薛燊1 , 何志凯1 , 豆少帅1 , 李琛1 , 郑兰兰1
1 湖北医药学院基础医学院, 药用植物实验室, 十堰, 442000; 2 湖北医药学院第一临床学院, 十堰, 442000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2019年07月25日    接受日期: 2019年09月04日    发表日期: 2020年02月12日
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摘要

胆木(Nauclea officinalis Pierre. ex Pitard)是中国著名南药,它有着悠久的用药历史。本研究采用 Illumina Hi-Seq 高通量测序技术,基于 K-mer 分析手段来研究胆木基因组的大小及杂合度,利用 MISA 方法分析可能的 SSR 分子标记。结果表明,胆木的基因组大小为 788.38 Mb,杂合度为 0.28%,重复序列比例为50.56%。在基因组序列中,进行 SSR 分子标记分析,共鉴定出了 237 398 SSR,其中,单、双核苷酸重复模体的比例较高。通过对传统南药胆木的基因组大小、杂合度调查及 SSR 分子标记分析,为胆木的道地性形成和资源保护及品种选育提供了遗传信息。

关键词
胆木;基因组大小;杂合度;SSR

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《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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